Trước năm 1978 là xã Hòa Khánh bao gồm xã Hòa Khánh Nam, xã Hòa Khánh Đông và xã Hòa Khánh Tây ngày nay.

Trong kháng chiến chống Pháp, xã Hòa Khánh là một trong những căn cứ địa quan trọng của ta ở phía tây Sài Gòn, đồng thời là một trong những nơi quân Pháp càn quét, đánh phá thường xuyên và ác liệt nhất.

Trong kháng chiến chống Mỹ, xã Hòa Khánh nằm trong vùng trọng điểm bình định và đánh phá của địch; là căn cứ quan trọng và là bàn đạp tấn công Sài Gòn của các lực lượng của ta trong cuộc tổng công kích, tổng tiến công Tết Mậu Thân năm 1968 và trong chiến dịch Hồ Chí Minh lịch sử tháng 4 năm 1975.

Nhìn chung xã Hòa Khánh là một trong những chiến trường ác liệt nhất ở vùng ven phía tây Sài Gòn trong 02 cuộc khánh chiến chống Pháp và chống Mỹ. Với những thành tích trong kháng chiến năm 1978 Nhân dân và lực lượng vũ trang xã Hòa Khánh huyện Đức Hòa tỉnh Long An được Đảng và và nước tuyên dương đơn vị Anh hùng lực lượng vũ trang nhân dân.

Sau năm 1975 do sự phát triển dân số ngày càng tăng đến năm 1979 xã Hòa Khánh được chia tách thành 03 xã Hòa Khánh Nam, xã Hòa Khánh Đông và xã Hòa Khánh Tây như ngày nay.

Xã Hòa Khánh Nam trước năm 2019 có ấp: Ấp Thuận Hòa 1, ấp Thuận Hòa 2, ấp Xuân Khánh 1 và ấp Xuân Khánh 2. Do  ấp Xuân Khánh 2 dân số ấp dưới 200 hộ theo quy định thông tư 04/2012/TT-BNV của Bộ Nội vụ nên đến năm 2019 sáp nhập ấp Xuân Khánh 1 và ấp Xuân Khánh 2 lại thành ấp Xuân Khánh. Hiện tại xã Hòa Khánh Nam có 03 ấp: Ấp Thuận Hòa 1, ấp Thuận Hòa 2 và ấp Xuân Khánh.